南通市妇幼保健院始建于1983年，历经近40年的稳步发展，已成为一所集医疗、预防、保健、教学、科研于一体的高水平三级甲等妇幼保健院。2015年增设儿童医院功能建制，挂牌南通市儿童医院。2023年下半年集门诊、急诊、住院、康复、保健为一体的儿童综合大楼启用。医院编制床位1090张，总建筑面积12.6万平方米，目前是南通大学附属妇幼保健院，并先后与复旦大学附属妇产科医院、复旦大学附属儿科医院、南京市妇幼保健院建立了战略合作伙伴关系。在全国公立医院妇产类绩效考核中，医院连续四年稳居第一方阵。医院相继建成国家级妇产介入标准化培训基地、国家住院医师规范化培训协同基地、江苏省新生儿危急重症救治中心、江苏省新生儿疾病筛查南通分中心、江苏省产前诊断筛查南通分中心、南通市孕产妇和新生儿危急重症救治中心。医院先后获得“国家级爱婴医院”“江苏省文明单位”“江苏省巾帼建功先进集体”“江苏省母婴友好医院”“江苏省母婴安全优质服务示范单位”“江苏省卫生健康系统先进集体”“江苏省健康促进医院”等国家、省级荣誉。